Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lcn6A2AJB9 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms