Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crlf3Q9Z2L7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crlf3Q9Z2L7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crlf3Q9Z2L7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crlf3Q9Z2L7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crlf3Q9Z2L7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crlf3Q9Z2L7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Crlf3Q9Z2L7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crlf3Q9Z2L7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crlf3Q9Z2L7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms