Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Robo3Q9Z2I4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo3Q9Z2I4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms