Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc45Q9Z1X9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdc45Q9Z1X9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc45Q9Z1X9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc45Q9Z1X9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc45Q9Z1X9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc45Q9Z1X9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc45Q9Z1X9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc45Q9Z1X9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc45Q9Z1X9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc45Q9Z1X9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms