Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R3

Apom, Apolipoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApomQ9Z1R3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ApomQ9Z1R3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApomQ9Z1R3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms