Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgr5Q9Z1P4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lgr5Q9Z1P4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms