Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arid3bQ9Z1N7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arid3bQ9Z1N7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid3bQ9Z1N7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms