Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms