Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms