Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1pr4Q9Z0L1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1pr4Q9Z0L1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms