Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip2Q9Z0H8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms