Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PoleQ9WVF7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PoleQ9WVF7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms