Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV92

Epb41l3, Band 4.1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l3Q9WV92 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Epb41l3Q9WV92 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Epb41l3Q9WV92 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l3Q9WV92 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms