Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcsQ9WU84 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms