Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus1Q9WU56 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms