Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ggps1Q9WTN0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ggps1Q9WTN0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms