Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam50bQ9WTJ8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam50bQ9WTJ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms