Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PplQ9R269 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PplQ9R269 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PplQ9R269 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PplQ9R269 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PplQ9R269 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PplQ9R269 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PplQ9R269 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PplQ9R269 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PplQ9R269 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms