Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpc2Q9R244 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms