Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim3Q9R1R2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim3Q9R1R2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms