Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trex2Q9R1A9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms