Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfwd2Q9R1A8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfwd2Q9R1A8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfwd2Q9R1A8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms