Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc26a4Q9R155 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc26a4Q9R155 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms