Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zeb2Q9R0G7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms