Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf346Q9R0B7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf346Q9R0B7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms