Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lamc3Q9R0B6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Lamc3Q9R0B6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Lamc3Q9R0B6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms