Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcamQ9R069 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms