Protein–RNA interactions for Protein: Q9R053

Scn11a, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn11aQ9R053 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn11aQ9R053 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn11aQ9R053 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn11aQ9R053 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms