Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AmfrQ9R049 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmfrQ9R049 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms