Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp11cQ9QZW0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp11cQ9QZW0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms