Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms