Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Map1aQ9QYR6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Map1aQ9QYR6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Map1aQ9QYR6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms