Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Opn4Q9QXZ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms