Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cbx8Q9QXV1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx8Q9QXV1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms