Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pcsk1nQ9QXV0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms