Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354bQ9QXT9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354bQ9QXT9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354bQ9QXT9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms