Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacl1Q9QXE0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacl1Q9QXE0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms