Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms