Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rai2Q9QVY8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rai2Q9QVY8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rai2Q9QVY8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms