Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mid2Q9QUS6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mid2Q9QUS6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms