Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cln8Q9QUK3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln8Q9QUK3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms