Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sfmbt1Q9JMD1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sfmbt1Q9JMD1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms