Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn6Q9JMB8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn6Q9JMB8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn6Q9JMB8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn6Q9JMB8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn6Q9JMB8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn6Q9JMB8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn6Q9JMB8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms