Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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