Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul3Q9JLV5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cul3Q9JLV5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms