Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm1Q9JLF6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm1Q9JLF6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms