Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nectin3Q9JLB9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Nectin3Q9JLB9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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