Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp39a1Q9JKJ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms