Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trem3Q9JKE1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms