Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uchl3Q9JKB1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms